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Estrutura dos Dados

Documentação v1

Esta documentação corresponde às extrações entregues até 20/09/2026. Consulte a versão atual.

Visão Geral​

Os dados extraídos de nosso banco clínico são organizados em duas seções principais:

  1. Campos de Metadados - Informações sobre paciente e documento (anonimizadas)
  2. Campos de Entidades Clínicas - Dados estruturados extraídos dos documentos médicos

Nota: Estes dados representam uma seleção específica de nosso banco de dados clínico, com ampla cobertura nacional e boa representatividade para estudos, filtrados conforme critérios definidos pelo cliente contratante.

Campos de Metadados do Paciente e do Documento​

CampoTipoDescrição
document_idstringIdentificador único do documento no banco de dados
document_datestringData de criação do documento clínico (YYYY-MM-DD HH:MM:SS)
patient_idstringID anonimizado do paciente (prefixo: "patient")
case_idstringID anonimizado do caso clínico (prefixo: "case")
genderstringSexo biológico do paciente (MALE, FEMALE, UNKNOWN). Ver detalhes abaixo.
birthdatestringData de nascimento do paciente (YYYY-MM-DD HH:MM:SS)
deathstringStatus de óbito do paciente (Y, N, X). Ver detalhes abaixo.
provider_state_codestringCódigo da Unidade Federativa do provedor
provider_typestringTipo de hospital (Público, Convênio, Particular). Ver detalhes abaixo.

Campos Adicionais​

Os campos abaixo podem ser contratados de forma adicional durante o processo de compra do banco de dados.

CampoTipoDescrição
payer_namestringIdentificador da fonte pagadora associada à nota clínica. Um mesmo paciente ou atendimento pode ter múltiplas fontes pagadoras, conforme os serviços registrados. Campo do tipo string, não normalizado, que representa diversos planos/convênios de saúde, SUS ou privado, podendo conter variações de grafia para uma mesma fonte, o que exige normalização prévia para fins analíticos.

Importante: Verifique com o time comercial durante as negociações para inclusão do campo.

Detalhamento dos Campos​

Campo death – Status de Óbito​

O campo death indica se há registro de óbito do paciente na base.

ValorDescrição
YSim – Óbito registrado
NNão – Sem registro de óbito
XNão especificado / Indisponível – Informação não consta ou não pôde ser definida

Campo gender – Sexo Biológico do Paciente​

O campo gender representa o sexo biológico do paciente, registrado nos documentos clínicos.

ValorDescrição
MALEMasculino
FEMALEFeminino
UNKNOWNNão especificado / Indisponível – Informação não consta ou não pôde ser definida

Campo provider_type – Tipo de Hospital​

O campo provider_type classifica o provedor quanto à natureza da gestão e da fonte pagadora.

ValorDescrição
PúblicoEstabelecimento exclusivamente da rede pública de saúde (SUS ou equivalente). Atendimento financiado pelo poder público.
Convênio ou ParticularEstabelecimento que atende por planos de saúde/convênios e/ou atendimento particular (privado), sem oferta pública.
Público, Convênio ou ParticularEstabelecimento que oferece atendimento nas três modalidades (público, convênio e particular).

Campos de Entidades Clínicas​

Campos Básicos da Entidade​

CampoTipoDescrição
entity_idstringID único da entidade (document_id + posição)
entitystringTermo clínico extraído do texto
labelstringCategoria da entidade clínica
assertionstringAserção sobre o contexto da entidade (AUSENTE, PRESENTE, POSSIVEL, HISTORICO) (quando disponível)

Campos de Terminologia (quando disponível)​

CampoTipoDescrição
terminologystringTerminologia utilizada (CID-10, ATC, TUSS)
term_codestringCódigo da terminologia
term_descstringDescrição do termo

Campos de Relação (quando aplicável)​

CampoTipoDescrição
relation_typestringTipo de relação com outra entidade
relation_entitystringEntidade relacionada
relation_positionstringPosição da entidade da linha na relação (head, tail)

Campos Estruturados para Exames e Biomarcadores​

Importante: Os campos abaixo são preenchidos apenas quando foi possível fazer a normalização/estruturação da entidade e se aplicam apenas às categorias especificadas:

CampoTipoCategorias AplicáveisDescrição
normalized_entitystringBIOMARKER, LAB_TEST, CLINICAL_ATTVersão padronizada da entidade (quando normalização foi possível)
numeric_valuenúmeroBIOMARKER, LAB_TEST, CLINICAL_ATTValor numérico extraído
unitstringBIOMARKER, LAB_TEST, CLINICAL_ATTUnidade de medida (quando disponível)
specific_markerstringBIOMARKER, LAB_TEST, CLINICAL_ATTMarcador específico de resultado
detection_statusstringBIOMARKER, LAB_TESTStatus de detecção do resultado
conditionstringCLINICAL_ATTCondições associadas
loinc_codestringBIOMARKERCódigo LOINC (quando disponível)

Detalhamentos e Informações Adicionais​

Campo de Asserção - Contexto das Entidades​

O campo assertion é uma classificação importante que indica o contexto clínico em que uma entidade foi mencionada no documento médico. Esta informação é crucial para análises precisas, pois o mesmo termo clínico pode ter significados diferentes dependendo do contexto.

Valores Possíveis de Asserção​

ValorDescriçãoExemplo de Uso
PRESENTEA entidade está confirmada no paciente"Paciente apresenta diabetes tipo 2"
AUSENTEA entidade está negada ou ausente"Paciente não apresenta hipertensão"
POSSIVELA entidade é suspeita ou possível"Suspeita de pneumonia" ou "Possível infarto"
HISTORICOA entidade é um histórico do paciente"Histórico de cirurgia cardíaca em 2020"

Importância para Análise de Dados​

A asserção é fundamental para análises precisas porque:

  • Evita falsos positivos: Entidades negadas (AUSENTE) não devem ser contadas como presentes
  • Identifica suspeitas: Entidades POSSIVEL podem indicar casos em investigação
  • Contextualiza histórico: Entidades HISTORICO fornecem informações sobre o passado do paciente
  • Melhora precisão: Permite análises mais refinadas considerando o contexto clínico

Exemplo Prático​

Texto: "Paciente nega diabetes, mas apresenta histórico de hipertensão.
Suspeita de insuficiência cardíaca."

Entidades extraídas:
- "diabetes" → assertion: AUSENTE
- "hipertensão" → assertion: HISTORICO
- "insuficiência cardíaca" → assertion: POSSIVEL

Categorias com Asserção​

O modelo de inferência de asserção é aplicado apenas às seguintes categorias de entidades:

DISEASE, PROCEDURE, PHARM_SUBSTANCE, SYMPTOM, FINDING, INJURY, VENT_SUPPORT, MEDICAL_DEVICE.

Nas demais categorias (por exemplo, BIOMARKER, LAB_TEST, CLINICAL_ATT, BODY_PART, TEMPORAL_CONCEPT, entre outras), o modelo de inferência não é aplicado. Essas entidades são tratadas como naturalmente presentes no contexto clínico do documento e não demandam classificação adicional. Deste modo, a ausência do campo preenchido não indica falha do modelo na inferência.

Campos de Terminologia - Normalização e Codificação​

Os campos de terminologia (terminology, term_code, term_desc) são aplicados apenas para 3 categorias específicas de entidades, quando foi possível fazer o mapeamento/normalização para terminologias médicas padronizadas.

Categorias com Terminologia​

CategoriaTerminologiaDescriçãoExemplo
DISEASECID-10Classificação Internacional de Doenças"diabetes tipo 2" → CID-10: E11
PROCEDURETUSSTerminologia Unificada da Saúde Suplementar"cirurgia cardíaca" → TUSS: 31001001
PHARM_SUBSTANCEATCAnatomical Therapeutic Chemical"metformina" → ATC: A10BA02

Exemplo Prático​

Entidade extraída: "diabetes mellitus tipo 2"
Categoria: DISEASE
Terminologia aplicada:
- terminology: "CID-10"
- term_code: "E11"
- term_desc: "Diabetes mellitus não-insulino-dependente"

Importante: Nem todas as entidades das categorias DISEASE, PROCEDURE e PHARM_SUBSTANCE terão campos de terminologia preenchidos. Isso ocorre apenas quando foi possível fazer o mapeamento automático para as terminologias padronizadas.

Categorias de Entidades Clínicas​

Labels Disponíveis​

LabelDescriçãoExemplo
DISEASEDoenças e condições médicas"diabetes", "hipertensão"
FINDINGAchados clínicos observados"edema", "icterícia"
SYMPTOMSinais e sintomas"dor", "febre"
PHARM_SUBSTANCESubstâncias farmacológicas"metformina", "insulina"
PROCEDUREProcedimentos médicos"cirurgia", "biópsia"
STAGEEstágios de progressão"estágio 3", "avançado"
SCALEEscalas clínicas"Glasgow", "APACHE"
VENT_SUPPORTSuporte respiratório"ventilação mecânica"
MEDICAL_DEVICEDispositivos médicos"cateter", "marca-passo"
INJURYLesões e traumas"fratura", "laceração"
HCARE_ACTIVITYAtividades assistenciais"fisioterapia", "enfermagem"
TEMPORAL_CONCEPTConceitos temporais"ontem", "crônico"
BODY_PARTPartes anatômicas"coração", "fígado"
BODY_LOCLocalizações específicas"ventrículo esquerdo"
MORPHOLOGYCaracterísticas morfológicas"hiperplasia", "atrofia"
BIOMARKERBiomarcadores"hemoglobina", "glicose"
LAB_TESTExames laboratoriais"hemograma", "urina"
CLINICAL_ATTSinais vitais"pressão arterial", "temperatura"

Tipos de Relação​

Relation TypeDescriçãoExemplo
is_date_ofAssocia data a evento"15/01/2024" → "cirurgia"
is_associated_anatomic_site_ofRelaciona entidade a local anatômico"tumor" → "fígado"
may_treatIndica tratamento possível"metformina" → "diabetes"
procedure_has_target_anatomyDefine alvo anatômico de procedimento"biópsia" → "fígado"
is_qualifier_ofQualifica ou modifica entidade"agudo" → "infarto"
may_diagnoseIndica capacidade diagnóstica"tomografia" → "tumor"
disease_has_primary_anatomic_siteRelaciona doença ao local primário"hepatite" → "fígado"
induced_byLiga entidade ao fator causador"úlcera" → "AINEs"
disease_has_findingAssocia doença a achado"diabetes" → "poliúria"
disease_has_metastatic_anatomic_siteDefine local metastático"câncer" → "pulmão"
disease_has_associated_anatomic_siteRelaciona doença a local associado"pneumonia" → "pulmão"

Importante: A extração de dados disponibilizada contém apenas os pacientes e documentos que atendem aos critérios específicos definidos para o projeto, representando uma amostra selecionada de nossa base, com ampla cobertura e representatividade.